Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PRPF4BQ13523 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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