Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK3Q13003 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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