Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTP4A2Q12974 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTP4A2Q12974 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms