Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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SMARCB1Q12824 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SMARCB1Q12824 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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