Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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PTPRMP28827 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRMP28827 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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