Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPRZ1P23471 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPRZ1P23471 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms