Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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