Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXC10Q9NYD6 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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HOXC10Q9NYD6 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXC10Q9NYD6 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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