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| UPP1 | Q16831 | AC104010.1-201 | ENST00000616889 | 150 nt | BASIC | 2.98 | □□□□□ -1.93 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AC068276.1-201 | ENST00000605793 | 379 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| UPP1 | Q16831 | GNAI3-201 | ENST00000369851 | 27174 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | POSTN-209 | ENST00000541179 | 3214 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC011460.1-201 | ENST00000636268 | 1834 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | AC092326.2-201 | ENST00000624772 | 1561 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | KIAA1524-206 | ENST00000491772 | 3877 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | TUG1-202 | ENST00000521091 | 2110 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | GABRG2-215 | ENST00000639213 | 9960 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | OR5B3-201 | ENST00000309403 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| UPP1 | Q16831 | Y_RNA.46-201 | ENST00000362695 | 102 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | RNU6-882P-201 | ENST00000391025 | 103 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| UPP1 | Q16831 | AP001136.1-201 | ENST00000425058 | 635 nt | TSL 2 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | AL162734.1-201 | ENST00000432858 | 157 nt | TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | MTND1P28-201 | ENST00000435623 | 950 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | HMGN2P20-201 | ENST00000437531 | 273 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | HIGD1AP11-201 | ENST00000438361 | 280 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| UPP1 | Q16831 | RPL22P17-201 | ENST00000438729 | 315 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |