Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CDKN3Q16667 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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