Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
VPS72Q15906 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPS72Q15906 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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