Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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