Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
BRD3Q15059 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.2 ms