Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SMCO1Q147U7 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMCO1Q147U7 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
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