Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RRP1BQ14684 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
RRP1BQ14684 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms