Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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UBE4AQ14139 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
UBE4AQ14139 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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