Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SPTAN1Q13813 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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