Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SMAD4Q13485 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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