Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
XRCC4Q13426 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
XRCC4Q13426 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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