Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
IFT88Q13099 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms