Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD10P28358 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD10P28358 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD10P28358 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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HOXD10P28358 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXD10P28358 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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