Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms