Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNX13Q9Y5W8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SNX13Q9Y5W8 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNX13Q9Y5W8 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNX13Q9Y5W8 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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SNX13Q9Y5W8 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SNX13Q9Y5W8 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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