Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
C4orf17Q53FE4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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