Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SP6Q3SY56 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms