Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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