Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TAF1AQ15573 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TAF1AQ15573 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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