Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNN3Q15417 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNN3Q15417 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNN3Q15417 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNN3Q15417 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNN3Q15417 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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