Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
NKX1-1Q15270 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NKX1-1Q15270 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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