Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PKP1Q13835 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PKP1Q13835 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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