Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ALCAMQ13740 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms