Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
TCOF1Q13428 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TCOF1Q13428 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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