Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
MSLNQ13421 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
MSLNQ13421 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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