Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CHD3Q12873 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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