Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRBP23467 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRBP23467 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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