Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ERVV-2B6SEH9 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms