Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
COPS7AQ9UBW8 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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