Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
ARHGEF3Q9NR81 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms