Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAMA3Q16787 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAMA3Q16787 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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