Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms