Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ALX1Q15699 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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