Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms