Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TRAM2Q15035 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms