Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SCARB2Q14108 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SCARB2Q14108 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms