Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PDE6HQ13956 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PDE6HQ13956 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms