Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
APOFQ13790 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
APOFQ13790 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms