Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ALCAMQ13740 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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