Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHAF1BQ13112 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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