Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
RAB40BQ12829 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB40BQ12829 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms