Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPREP23469 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
PTPREP23469 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPREP23469 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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